明军首先占据各个重要的街道和路口，然后开始沿着街道，逐屋与荷兰人争夺，并迅速从西面向中心推进。
李定国进城之后，没有深入，他站在城门处，见属下士卒打着火炬跑步通过幽暗的门洞，衣甲摩擦的声音和密集而又整齐的脚步，传入他的耳中。
他再抬头看向城内，堡内的街道上，枪声和喊杀声响城一片，声音和街道上弥漫的硝烟，一起缓缓上升，最后在空中消散。
虽然杀入城中，但是巷战依然激烈。
此时在主堡内，总督科尔瑞的办公室内一片慌乱，纸张和文件散落了一地。
“总督阁下，明人已经攻入堡内，荷兰的士兵正在西城区与明人激战，但是他们人多，估计很快就会占据西城区，向总督府推进！”一名荷夷军官，手里提着一把冒烟的手枪冲进来，慌张的说道。
科尔瑞面色狰狞，“思迪乌，你马上带人在街道上布防，不要让明人冲过来，另外组织人手，将仓库中的粮食，运进总督府来。”
总督府是整个巴达维亚的中心，修得十分高大，并且坚固，是整个堡垒的中心，也是第三道防线，科尔瑞决定凭着最后一道工事坚守。
“阁下，粮库发生叛乱，早就被叛贼点燃了！”那名叫思迪乌的议员，却急道：“阁下请恕我直言，公司在南洋，以及在对待明朝的策略上，完全且彻底的失败了！现在只有趁着，明人只占据西城区，我们立刻从北面突围，乘船冲出巴达维亚！”
粮库被烧，那坚守主堡也没有意义，最后只能向马六甲一样，粮尽而降。
“该死！”科尔瑞怒骂一声，但是不得不承认失败，荷兰人是来赚钱的，不是来玩命的，他现在只能承认失败了，“让议员们收拾一下，我们马上撤退。”
这样一来，荷兰东印度公司将一下失去南洋，海上的马车夫，在西方刚被英国人击败，在东方又被明朝打败。
这个雄霸海洋数十年的海权大国，注定要没落，而且比历史上衰落得更快，几乎就是这几年间，便沦为边缘。
城中街道上，四处都在厮杀，周岱带进城来的三百多人，估计已经死了大半，剩下的也被杀散。
在明军冲入城中后，周岱便改变了方向，带着人马向总督府的方向突击，他们进入一条街道，旁边有跪着将枪举起的荷兰人，说着众人听不懂的荷兰话，似乎是在求饶和投降。
周岱听不懂他们的话语，但只要跪地举起手来，他都没有理会，但是身后的几民汉子见了红毛鬼，却抬枪就射。
“砰”的一声枪响，就打的那跪地的荷兰人，身体倒飞，撞在街道边的墙上。
这些汉子刚开始打枪都不准，见血还吐得稀里哗啦，但等连着杀了几人后，便已经红了眼，见了荷兰人就杀。
这时他们撞开一间屋子，几个荷兰人的伤兵躺在里面，他们惊恐的望着进来的周岱等人，其中一名荷夷哭得稀里哗啦，鼻涕眼泪流了一脸，嘴里连连求饶，周岱刚准备发话，便听身后一阵“砰砰砰”的铳响，将屋里的荷兰人全都杀了。
此时因为殖民当局已经没了抵抗的意志，城中的散兵无人指挥，明军进展突飞猛进，迅速占领各个街区，并开始组织人手控制火势。
忽然一阵巨大的欢呼声响起，那是明军已经冲进了总督府。
科尔瑞与东印度公司的高层们，逃出堡内，他们听见身后的欢呼声，转头看去，北段堡墙上已经出现了大量的火炬，更有一队人马，从北城出来，向码头追来。
科尔瑞吓得面无人色，纵横海上的荷兰人，仓皇的从码头分别登上三艘武装商船，船只刚起锚杨帆，穿着红色布甲的明军火铳手，已经杀到码头，蹲着朝离开码头的大船射出一阵排铳。
荷兰人顾不得打上一炮，便仓皇逃出海港，而他们刚出海面，便遇上了游弋的明军战船。
双方在黑暗中一场混战，三艘荷夷战船，一艘被击沉，一艘被俘，一艘趁着夜色，向北逃离······